实验室实行理事会管理下的主任负责制，并聘请了有关领域国内知名专家、学者成立学术委员会。实验室主任全面负责实验室具体工作，副主任主要负责学术交流、人才培养、科学研究和日常管理等各项工作，各研究中心负责人分工明确。实验室下设办公室，负责实验室日常管理和服务工作，办公室设主任1名，副主任4名，办公室主任在实验室主任的领导下全面负责实验室的日常管理与运行。

实验室人员实行聘任制。骨干固定人员由重点实验室主任聘任，其余固定人员和流动人员由骨干固定人员聘任，重点实验室主任核准。固定人员包括研究人员、技术人员和管理人员，流动人员包括访问学者、博士后研究人员、博硕士研究生。

实验室实行目标考核，建立人员聘用、考评与激励机制、评价体系、资源配置与支持方式，科研协同管理机制，全面实行技术服务人员目标管理制、研发人员项目制、咨询服务人员责任落实制。